Os Raios X e elétrons são de natureza electrónica e interferem com o meio electrónico. Há elementos com pouca corteza e por tanto hidrógenos e átomos muito ligeiros não se podem determinar com as técnicas de difracción de Raios X ou com difracción de elétrons. A alternativa é utilizar proyectiles que impacten sobre os núcleos e por isso se desenvolveu a difracción de neutrones.
Os neutrones caem dentro do campo do núcleo e incidem sobre objectivos nucleares, e é por isso que é uma técnica utilizada principalmente por físicos.